1、土地性质不同：商业公寓是商业用地，土地使用年限一般为40年或50年。住宅公寓是住宅用地，土地使用年限为70年。
2、税费不同：商业公寓交纳的税费比住宅公寓要高，另外如果交易二手商业公寓，个税和增值税都不能享受住宅的减免政策。
3、贷款利率和首付不同：银行对于商业地产的贷款首付以及利率都较高，且无法使用公积金，且贷款年限只有十年。而住宅公寓贷款首付及利率都要低很多，且贷款年限最长可达30年。
4、生活费用不同：商业公寓的生活用电、用水、物业费都是按照商业用途收取的，比住宅房高出很多。而住宅公寓按照民用收费标准计算，价格低很多。
5、居住环境不同：商业公寓居住密度比较大，日照通风条件相对恶劣，楼下几乎没有公共活动区域和绿化景观可享。住宅公寓则与普通住宅一样，居住环境舒适性更高。
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